Du lundi 21 au vendredi 25 septembre 2015 à la Station Biologique de Roscoff
Contexte et enjeux
Le traitement des données métabolomiques issues des deux technologies principales non-ciblées que sont la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse haute-résolution (LC-HRMS) et la résonance magnétique nucléaire (RMN) est un enjeu majeur pour obtenir des résultats de qualité, robustes et riches en annotations chimiques et biologiques.
L'Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l'Infrastructure Nationale de Métabolomique et de Fluxomique (MetaboHUB) , se sont associés pour développer une plateforme en ligne, Workflow4metabolomics (W4M) réunissant un large spectre d'outils (depuis le prétraitement des données brutes jusqu'à l'annotation). Grâce aux fonctionnalités de l'environnement Galaxy , permettant à l'utilisateur de combiner les modules de traitement de son choix de manière ergonomique, de stocker et d'échanger les workflows, les utilisateurs peuvent aujourd’hui disposer d’une solution adaptée.
Objectifs de l'école
L'école s'adresse aux expérimentateurs utilisant les technologies LC-HRMS et RMN. Son objectif est de former à l'utilisation des outils de prétraitement, d'analyse et d'annotation des données métabolomiques disponibles sur la plateforme W4M, ainsi qu'à la gestion des workflows. Le programme est en ligne et la moitié du temps environ sera consacrée aux travaux pratiques sur ordinateur. Par ailleurs, chaque participant se verra en outre attribuer un tuteur qui l'accompagnera dans l'analyse d'un jeu de données de son choix durant les deux dernières demi-journées.
Le nombre maximum de participants est fixé à 25. Les candidats seront sélectionnés par les organisateurs grâce à un questionnaire lors de la pre-inscription de manière à :
- privilégier les expérimentateurs venant d’acquérir un jeu de données et ayant commencé leur traitement,
- assurer une représentativité la plus large possible des laboratoires.
Les supports seront rédigés en anglais. La langue orale sera le français.
Participation
Les tarifs (HT) s'élèvent à :
| Académique | 750 euros | Industriel | 1400 euros |
Les frais d'inscription comprennent l'hébergement (pension complète), le dîner de Gala, et les supports pédagogiques. Les frais de transport sont à la charge des participants.
Pour tout complément d'informations : w4mcourse2015.organisation@sb-roscoff.fr